Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD4Q9NVD3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SETD4Q9NVD3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms