Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMBRD1Q9NUN5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms