Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EMILIN3Q9NT22 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EMILIN3Q9NT22 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms