Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM8Q9NQV8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms