Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CRTAC1Q9NQ79 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms