Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPHS2Q9NP85 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHS2Q9NP85 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms