Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC4Q9HBW1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.6 ms