Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP44Q9C0F1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms