Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP3Q9BZ76 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTNAP3Q9BZ76 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms