Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RNF17Q9BXT8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RNF17Q9BXT8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms