Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPOQ9BU64 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPOQ9BU64 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPOQ9BU64 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPOQ9BU64 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPOQ9BU64 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPOQ9BU64 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPOQ9BU64 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPOQ9BU64 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPOQ9BU64 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPOQ9BU64 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPOQ9BU64 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPOQ9BU64 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPOQ9BU64 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CENPOQ9BU64 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CENPOQ9BU64 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CENPOQ9BU64 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CENPOQ9BU64 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPOQ9BU64 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPOQ9BU64 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPOQ9BU64 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPOQ9BU64 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPOQ9BU64 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPOQ9BU64 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPOQ9BU64 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPOQ9BU64 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPOQ9BU64 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPOQ9BU64 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPOQ9BU64 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms