Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBM4BQ9BQ04 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms