Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN18Q99952 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms