Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NOTCH4Q99466 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms