Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMD1Q99460 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMD1Q99460 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 260.7 ms