Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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