Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3IPQ96QF0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms