Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC9Q96Q05 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms