Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMTM3Q96MX0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CMTM3Q96MX0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CMTM3Q96MX0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CMTM3Q96MX0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CMTM3Q96MX0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CMTM3Q96MX0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CMTM3Q96MX0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CMTM3Q96MX0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms