Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms