Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDLIM2Q96JY6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms