Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCHS1Q96JQ0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms