Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPD52L3Q96J77 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms