Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SMARCD1Q96GM5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCD1Q96GM5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCD1Q96GM5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCD1Q96GM5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCD1Q96GM5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCD1Q96GM5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCD1Q96GM5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms