Protein–RNA interactions for Protein: Q96F44

TRIM11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM11Q96F44 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM11Q96F44 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms