Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG4CQ96DT6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG4CQ96DT6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms