Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN23Q96B33 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms