Protein–RNA interactions for Protein: Q92871

PMM1, Phosphomannomutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMM1Q92871 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PMM1Q92871 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMM1Q92871 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PMM1Q92871 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PMM1Q92871 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PMM1Q92871 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMM1Q92871 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMM1Q92871 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PMM1Q92871 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms