Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIFAP3Q92845 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIFAP3Q92845 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms