Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK9Q8TD19 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms