Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 OSBPL10-214ENST00000479173 554 ntTSL 43.81□□□□□ -1.85e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.825e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.825e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 USP53-205ENST00000509769 4803 ntTSL 1 (best)3.52□□□□□ -1.855e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.955e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.955e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.075e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 HEATR5B-202ENST00000425467 433 ntTSL 35.87□□□□□ -1.472e-7■■■■■ 56.4
PUM2Q8TB72 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.82e-7■■■■■ 56.4
PUM2Q8TB72 WDR13-206ENST00000479279 2486 ntTSL 1 (best)17.99■□□□□ 0.475e-32■■■■■ 56.4
PUM2Q8TB72 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.285e-32■■■■■ 56.4
PUM2Q8TB72 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.225e-32■■■■■ 56.4
PUM2Q8TB72 WDR13-210ENST00000492873 470 ntTSL 213.55□□□□□ -0.245e-32■■■■■ 56.4
PUM2Q8TB72 TMEM14C-203ENST00000467415 899 ntTSL 313.46□□□□□ -0.252e-44■■■■■ 56.4
PUM2Q8TB72 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.292e-44■■■■■ 56.4
PUM2Q8TB72 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.362e-44■■■■■ 56.4
PUM2Q8TB72 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 56.3
PUM2Q8TB72 ZNF574-201ENST00000222339 3309 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 56.3
PUM2Q8TB72 ZNF574-204ENST00000600245 3598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 56.3
PUM2Q8TB72 SLC38A2-201ENST00000256689 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.012e-56■■■■■ 56.3
PUM2Q8TB72 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 56.2
PUM2Q8TB72 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 56.2
PUM2Q8TB72 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.312e-7■■■■■ 56.2
PUM2Q8TB72 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.441e-14■■■■■ 56.1
PUM2Q8TB72 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.541e-14■■■■■ 56.1
PUM2Q8TB72 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.36e-10■■■■■ 56
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PUM2Q8TB72 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.183e-9■■■■■ 55.9
PUM2Q8TB72 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.553e-12■■■■■ 55.7
PUM2Q8TB72 MT1X-204ENST00000568370 1727 nt15.23■□□□□ 0.032e-15■■■■■ 55.6
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PUM2Q8TB72 MT1X-201ENST00000394485 450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.132e-15■■■■■ 55.6
PUM2Q8TB72 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-19■■■■■ 55.5
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PUM2Q8TB72 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.472e-19■■■■■ 55.5
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PUM2Q8TB72 BCOR-204ENST00000378463 2230 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.689e-10■■■■■ 55.5
PUM2Q8TB72 BCOR-210ENST00000442018 2189 ntTSL 210.63□□□□□ -0.719e-10■■■■■ 55.5
PUM2Q8TB72 BCOR-209ENST00000427012 1969 ntTSL 58.3□□□□□ -1.089e-10■■■■■ 55.5
PUM2Q8TB72 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.114e-8■■■■■ 55.2
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PUM2Q8TB72 CDCA5-210ENST00000533015 563 ntTSL 210.87□□□□□ -0.674e-8■■■■■ 55.2
PUM2Q8TB72 CDCA5-206ENST00000525464 672 ntTSL 59.84□□□□□ -0.834e-8■■■■■ 55.2
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PUM2Q8TB72 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 55.1
PUM2Q8TB72 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 55.1
PUM2Q8TB72 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 55.1
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PUM2Q8TB72 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.446e-10■■■■■ 55.1
PUM2Q8TB72 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.516e-10■■■■■ 55.1
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PUM2Q8TB72 DDX24-201ENST00000330836 2738 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.222e-14■■■■■ 55
PUM2Q8TB72 DDX24-204ENST00000553451 486 ntTSL 34.45□□□□□ -1.72e-14■■■■■ 55
PUM2Q8TB72 VPS4B-201ENST00000238497 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.111e-15■■■■■ 55
PUM2Q8TB72 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.042e-10■■■■■ 55
PUM2Q8TB72 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 54.9
PUM2Q8TB72 ELOVL7-201ENST00000425382 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 54.9
PUM2Q8TB72 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.642e-7■■■■■ 54.9
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PUM2Q8TB72 ARHGAP12-208ENST00000493008 2334 ntTSL 24.41□□□□□ -1.73e-6■■■■■ 54.9
PUM2Q8TB72 ARHGAP12-207ENST00000492028 3227 ntTSL 1 (best)4.17□□□□□ -1.743e-6■■■■■ 54.9
PUM2Q8TB72 SYNJ1-202ENST00000382491 6958 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.877e-7■■■■■ 54.9
PUM2Q8TB72 SYNJ1-203ENST00000382499 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.897e-7■■■■■ 54.9
PUM2Q8TB72 SYNJ1-201ENST00000357345 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.897e-7■■■■■ 54.9
PUM2Q8TB72 SYNJ1-211ENST00000630077 6898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.937e-7■■■■■ 54.9
PUM2Q8TB72 SYNJ1-207ENST00000438952 3604 ntTSL 55.24□□□□□ -1.577e-7■■■■■ 54.9
PUM2Q8TB72 LDLR-201ENST00000252444 5337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.1□□□□□ -0.311e-10■■■■■ 54.9
PUM2Q8TB72 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 54.9
PUM2Q8TB72 C1QBP-202ENST00000570805 688 ntTSL 39.24□□□□□ -0.933e-7■■■■■ 54.9
PUM2Q8TB72 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.039e-9■■■■■ 54.9
PUM2Q8TB72 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.369e-9■■■■■ 54.9
PUM2Q8TB72 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.379e-9■■■■■ 54.9
PUM2Q8TB72 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.449e-9■■■■■ 54.9
PUM2Q8TB72 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.559e-9■■■■■ 54.9
PUM2Q8TB72 BCL2L11-223ENST00000622612 4995 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.569e-9■■■■■ 54.9
PUM2Q8TB72 BCL2L11-218ENST00000615946 5026 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.629e-9■■■■■ 54.9
PUM2Q8TB72 BCL2L11-220ENST00000620862 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.629e-9■■■■■ 54.9
PUM2Q8TB72 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.621e-15■■■■■ 54.8
PUM2Q8TB72 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.021e-15■■■■■ 54.8
PUM2Q8TB72 C10orf90-208ENST00000488181 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.41□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 54.8
PUM2Q8TB72 PUM1-201ENST00000257075 5360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.772e-27■■■■■ 54.7
PUM2Q8TB72 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.122e-27■■■■■ 54.7
PUM2Q8TB72 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.22e-27■■■■■ 54.7
PUM2Q8TB72 SLTM-202ENST00000380516 4147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.892e-8■■■■■ 54.7
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