Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP35Q8NFH5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms