Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF397Q8NF99 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms