Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC44A5Q8NCS7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC44A5Q8NCS7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC44A5Q8NCS7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC44A5Q8NCS7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC44A5Q8NCS7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC44A5Q8NCS7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC44A5Q8NCS7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC44A5Q8NCS7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC44A5Q8NCS7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC44A5Q8NCS7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC44A5Q8NCS7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC44A5Q8NCS7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC44A5Q8NCS7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms