Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SMIM20Q8N5G0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM20Q8N5G0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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