Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHCHD4Q8N4Q1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
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