Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT20Q8IY31 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT20Q8IY31 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms