Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN4Q8IWV2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms