Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC8AQ8IWT6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms