Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00523Q86TU6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms