Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP34Q70CQ2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms