Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC23A3Q6PIS1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC23A3Q6PIS1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms