Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFWD3Q6PCD5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms