Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO42Q6P3S6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms