Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN1Q6NZI2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.6 ms