Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGMBQ6NW40 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms