Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMBOX1Q6NT76 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms