Protein–RNA interactions for Protein: Q5W5X9

TTC23, Tetratricopeptide repeat protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC23Q5W5X9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC23Q5W5X9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TTC23Q5W5X9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms