Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CEP350Q5VT06 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CEP350Q5VT06 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms