Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGSNQ5TDP6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms